重組菌當中的外源基因是否表達可以通過幾個層面進行分析

2021-04-17 22:22:43 字數 3531 閱讀 1219

1樓:鵝子野心

實驗目的

瞭解iptg誘導的外源基因在大腸桿菌中的表達的原理,掌握外源基因在大腸桿菌中的表達及其檢測技術。

實驗原理

將外源基因克隆在含有lac 啟動子的表達載體中,讓其在大腸桿菌中表達。沒有加入iptg誘導劑的時候,laci 產生的阻遏蛋白與lac 操縱基因結合,從而不能進行外源基因的轉錄和表達,而只有表達載體隨大腸桿菌的增殖和複製;當加入iptg後,阻遏蛋白不能與操縱基因結合,則dna外源基因大量轉錄並高效表達。表達的蛋白可以通過sds-page進行初步鑑定。

不同的蛋白質分子具有不同的電荷和分子量。蛋白質在強陰離子去汙劑sds與某一還原劑(如二巰基乙醇)共同作用下並加熱使蛋白質解離後,變性的蛋白質與sds結合並因此而帶負電荷,不同的蛋白質結合sds的量僅與分子量成正比而與氨基酸的序列無關,在sds-page電泳時,蛋白質在聚丙烯醯胺中的遷移率僅僅取決於蛋白質的分子量。

聚丙烯醯胺凝膠電泳由丙烯醯胺單體和交聯劑n,n′—亞甲基雙丙烯醯胺在催化劑作用下,形成三維網狀結構。凝膠電泳不僅具有分辨不同分子量蛋白質的作用(即分子篩作用),還具有濃縮作用。由於不連續緩衝系統具有把樣品中的sds-多肽複合物全部濃縮於極小體積的能力,從而提高了解析度。

採用考馬斯亮藍快速染色,可及時觀察電泳分離效果。

實驗內容

材料:含有重組表達載體pet-b1, 空表達載體pet28b的大腸桿菌bl21。

試劑:細菌培養用的lb液體培養基,(含50μg/ml的卡那黴素)

lb平板(含50μg/ml的卡那黴素),100mmiptg,

10mg/ml的溶菌酶(10mm tris-hcl,ph8.0配製),

sds-page用試劑及考馬斯亮藍r250

30%(w/v)凝膠貯存液(丙烯醯胺具有神經毒性,操作時要戴手套和口罩)

丙烯醯胺29g,亞甲雙丙烯醯胺1g, 加ddh2o溶至100ml,用新華3號濾紙過濾,棕色瓶中4℃儲存,每隔幾個月須重新配製。

tris-hcl,ph8.8 1.5mol/l

0.5mol/l tris—hcl,ph 6.8。

10%sds。

10%過硫酸銨(ap,新鮮配製)。

temed(四甲基乙二胺)。

tris-甘氨酸電泳緩衝液,ph8.3,可配成5×貯存液備用,臨用前稀釋。

工作液 5×貯存液

tris鹼 25 mmol/l tris鹼 15.1g

甘氨酸 250mmol/l (ph 8.3) 甘氨酸 94g

sds 0.1% 1%sds 50ml

加ddh2o 至1000ml

樣品處理液

deionized water 3.8 ml

0.5 m tris-hcl, ph 6.8 1.0 ml

glycerol 0.8 ml

10% (w/v) sds 1.6 ml

2-mercaptoethanol 0.4 ml

1% (w/v) bromophenol blue 0.4 ml

染色液 0.4%考馬斯亮藍—r250染色液。

甲醇 400m1

冰乙酸 100ml

考馬斯亮藍r250 1g

ddh2o加至 1000m1

脫色液甲醇 400ml

冰乙酸 100ml

ddh2o 500ml

操作步驟

1將凍存的含有組表達載體pet-b1, 空表達載體pet28b的大腸桿菌bl21畫線接種在lb平板上,37度培養過夜,直至平板上長出單菌落。

2 挑取單菌落至5mllb液體培養基中,培養至od600=0.6左右。4度放置過夜。

3 取2ml培養菌加入到48ml培養基中,繼續培養至od600=0.4-0.6之間。

4 表達載體和重組載體都分別設定誘導組與不誘導組,誘導組加入終濃度為1mm的iptg,不誘導組不加iptg。25度誘導培養12h。

5 取1.5ml培養菌至離心管中,5000rpm離心1分鐘,收集細菌。

6 用1ml 10mm tris-hcl(ph8.0)懸浮細菌,5000rpm離心1分鐘,收集細菌。

7 加入30ul的 10mg/ml的溶菌酶,充分懸浮,4度放置2小時以上。

8 製備4%濃縮膠,12%的分離膠的sds-page膠。

按下表製備濃縮膠

水 6.1

30%丙烯醯胺溶液 1.33

0.5mol/l tris-hcl ph 6.8 2.5

10%sds 0.1

10%ap 0.05

temed 0.01

按下表製備分離膠

外源基因的表達與檢測

9 超聲處理5分鐘,每30秒間隔50秒,12000rpm離心10分鐘,取上清作為蛋白樣品。

10 渠5ul測定蛋白濃度。

11 取50ug蛋白上樣,加入5ul上樣緩衝液,沸水浴5分鐘,瞬時離心後上樣。

12 170v恆壓電泳至溴酚藍至凝膠前沿。

13 染色1小時

14 脫色至條帶清晰,背景明亮為止。

結果: 誘導的pet-b1菌液樣品在分子量61kda處有一明顯的深厚條帶,而其他三種處理沒有此條帶。

影響蛋白質電泳分離效果的因素

1.蛋白質樣品中的鹽濃度 影響蛋白條帶的遷移率和帶型,因此為消除鹽濃度的影響,溶解蛋白時最好用去離子水,再加等量2×sds-page樣品緩衝液,必要時經過透析或進行sephader g25過柱。

2.sds的質量 由於變性蛋白是與sds結合而帶負電荷,蛋白結合sds的量與蛋白質的分子量成正比,因此質量不同的sds,相同的蛋白質樣品,將可能出現不同遷移率的電泳圖譜。

3.上樣孔是否平齊,若上樣孔不平齊,也影響蛋白電泳的遷移率。

4.為防止相鄰泳道樣品的擴散,而導致電泳條帶的不整齊,如有空置的加樣孔,須加等體積的空白1×sds樣品緩衝液。

電泳樣品的準備

1.濃度 單一成分1—10μg,若濃度太稀,應沉澱後再進行電泳;對於非單一成分的樣品,如基因工程大腸桿菌的表達產物,其蛋白量50~100μg可取得較好的分離效果。

2.體積 樣品體積儘可能小,以保證電泳條帶的整齊,必要時可應用6×sds加樣緩衝液以增加蛋白質的加樣量。

3.鹽濃度應儘可能低,可用sephaderg25快速脫鹽;鉀離子(k+)要除去,因為鉀離子沉澱sds。

4.分離小分子肽時,分離膠的濃度可提高到20%~25%。

5. 對照孔加入蛋白質分子量標準樣品,同樣也須1000c處理 3~5min。

注意事項

1. 丙烯醯胺單體和交聯劑n,n′—亞甲基雙丙烯醯胺有神經毒性,在稱量和配製時要帶一次性手套,稱量時最好也戴上口罩。

2. 凝固後一般不再有毒性,但考慮到存在沒有完全交連的分子,實驗結束後不宜直接用手拿取,要先用清水漂洗5-10分鐘。

3. 室溫較低時膠液不易凝固,可以在槽中加370c溫水。

4. sds很容易漂浮在空氣中而吸入體內,稱量時最好在通風櫥中進行,或戴上口罩。

5. 在實際操作中,很容易將電極接反,請注意,負極永遠接在加樣孔的一端(即上負下正)

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