1樓:匿名使用者
在基因組研究領域,人們對資料的可信度有一個基本的要求:單個鹼基越準確越好,對單個鹼基的覆蓋深度越多倍越好,對整個基因組測得越完整越好,測序的「缺口(gap)」越少越好。
新一代測序中,基因從頭測序和重測序有什麼區別?我要做乙肝病毒dna全長測序,應該選用哪種方法?
2樓:那年丶人已散盡
1、條件不同
從頭測序的條件是不依賴於任何物種基因組;重測序的條件是在已知物種基因組的情況下進行的。
2、病毒變異率不同
從頭測序是通過拼接和組裝的方式獲得基因組序列圖譜,病毒變異率很低;重測序可以尋找出大量的單核苷酸多型性位點,插入缺失位點,結構變異位點,拷貝數變異等變異資訊,從而獲得生物群體的遺傳特徵。病毒變異率很高。
乙肝病毒在醫學上已經測過,只需要做重測序就可以。
3樓:匿名使用者
從頭測序是目前為止還沒有人測過那個物種的全基因組,沒有參考序列進行比對,需要自己組裝拼接後才能知道序列;而重測序是已經有人測過了,只需要重新測序,有參考序列了,只需要與參考序列比對。
乙肝病毒好像是已經測過的,只需要做重測序就可以!
4樓:美吉生物
基因從頭測序也叫做基因de novo測序,是指不依賴於任何已知基因組序列資訊對某個物種的基因組進行測序,然後應用生物資訊學手段對測序序列進行拼接和組裝,最終獲得該物種基因組序列圖譜。
重測序是指在已知物種基因組的情況下,對物種內的不同個體或某個個體的不同組織進行基因組重測序,可以在全基因組水平上發現不同個體或組織細胞之間的差異。通過這種方法,可以尋找出大量的單核苷酸多型性位點(snp),插入缺失位點(indel,insertion deletion),結構變異位點(sv,structure variation),拷貝數變異(copy number variation,**v)等變異資訊,從而獲得生物群體的遺傳特徵。
病毒變異率很高,一般不用重測序,可以用de novo從頭測序。
5樓:匿名使用者
專業性東西,自己看看這個
資料
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