RT PCR產物電泳結果只有引物二聚體,沒有目的條帶,更換引物了也這樣,求高手解答原因啊!高分

2021-05-16 23:56:49 字數 886 閱讀 6361

1樓:匿名使用者

1. 樓上說的都很有道來理。不同的taq確實效果源很不bai一樣。

在我所使用du過的幾十種酶中,發現凡是遇到zhi困難的dao模板,qiagen 的hotstart master mix plus一般都可以得到產物,所以我強烈推薦(可以試試配合q solution一起使用,一般免費索取)

2. 另外就是,你的目標基因的表達量是不是很低?你的pcr目的是什麼?

建議先找一個表達丰度高的體系,驗證一下你的引物是否工作。對於極低表達丰度的目標,一輪pcr很有可能得不到產物,這是建議使用nested pcr,就是設計2套巢狀的引物,第一輪先用外面的那對,理論上可以得到一個比較大的產物(跑膠不一定能看到),然後稀釋pcr產物50倍,再用裡面那對引物擴一次,一般可以得到跑膠看得見的產物量。

3. 關於引物設計,推薦使用primer3 plus,這是免費的網上設計軟體,很好用。比你用的那2種引用次數多很多。你google一下就可以了。

2樓:紫電

個人覺得

抄mix質量一般,mix一般是襲用來做檢測用的,比如說提取出來了質粒做克隆鑑定啊,或者是轉基因動物做基因型鑑定用的。你要用cdna做模板的話,建議用專門的pcr的酶,這樣也可以改體系中的不同組分,比如說可以把mg離子濃度提高一些。

我建議你改用好一些的taq酶去pcr試試,比如說la taq,primer star或者pfu什麼的,保真度高。另外,你也可以試試把退火溫度再降低一下,你的退火溫度是在引物的tm值附近的嗎?

3樓:匿名使用者

不要用mix試試吧!

用taq dna buffer、dntps、mg2+、引物、taqdna聚合酶試試。

退火溫度在40到70度間都試試。可能是退火溫度已經太低了所以出現雜帶。

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