高度保守的兩個基因,如何做qPCR?

2025-04-23 20:15:59 字數 2434 閱讀 8140

1樓:任性的公貓

qpcr至少有以下特點:

所用儀器少,只用一臺儀器。

檢測時間短,只須45分悶叢純鍾~1小時10分鐘(試劑各異),而定性pcr須3~4小時,酶免終點定量須6~8小時,螢光終點定量須2~3小時。

操作極其簡單:前處理後,樣本插入儀器一小時後到電腦上來出報告即可鄭鋒,無須開蓋,移樣本(以前方法),避免汙染。

結果精確:定性pcr只能定性,很粗略,終點定量pcr由於只能在40個熱迴圈結束後檢測螢光,被測螢光達到飽和導致定量不夠精確,屬於半定螞咐量狀態。而即時螢光qpcr是在擴增的每時每刻連續檢測各樣本的螢光值的變化。

如何知道基因是否是高度保守性的

2樓:匿名使用者

保守性一般是在進化理論中應用較多,「保守性好」指的是發生突變的幾率低隨著遺傳學和分子生物學的進步,進化方面的研究已經遠遠超過物種外在表型的水平了。科學家研究遺傳物質,一般是dna的序列發現,分類學上親緣關係較近的物種的基因資訊之間的差異也較小,而親緣關係較遠的物種間基因資訊之間的差異也較大。同時由於dna經過轉錄和翻譯表達蛋白,故蛋白質中的氨基酸序列與dna含的遺傳資訊也存在很多相關性。

故對不同物種間同種蛋白的氨基酸序列分析也是用於研究進化問題的有力方法。以蛋白為例,一般用於進化或物種親緣關係分析的蛋白都含有可變部分——非保守區,和穩定部分——保守區。對於進化上相關的物種,同種蛋白的保守區序列高度相似(前提是都含有此種蛋白);而非保守區序列因物種間差異的增大而逐漸明顯,這是變異加自然選擇在分子水平的結果。

並且科學家通過計算非保守區序列的變換特點發現,自然變異幾率基本固定,故還能從含同一蛋白的不同物種間計算它們在進化中大致的相差年代。故更準確地說,要分析不同物種間差異性,更多要分析其生物大分子的非保守區序列差異。

核糖體rrna在進化上是高度保守的,在基因組中拷貝數多,怎樣理解?

3樓:網友

高度保守指的是在長期進化中,或者是多個物種間,編碼該rrna的序列保持高度的一致性,使得在不同物種中,核糖體rrna幾乎是一樣的。

拷貝數的多少可以大致理解為表達的多少,這兩個不能劃等號,但是對於核糖體rrna來說是這樣,其拷貝數多,表達量高。

想做細菌基因的qpcr,不知道內參基因如何選擇

4樓:秋雨梧桐葉落石

我也遇到了類似的問題。提取組織rna反轉錄後做q-pcr,選18s做內參基因。以前做一般都10個迴圈左右,最近這一批組織卻22個迴圈。

溶解曲線也是好的,反轉錄體系也沒有問題(用以往的rna同時反轉錄做q-pcr,18s的ct值還是10左右)。提取rna好像也沒有問題。我是分離了組織中的成熟細胞部分,確實不好提rna,但是濃度也有300ng/ul左右,260/280是。

如何通過qpcr比較不同基因的表達

5樓:網友

對同一種樣本,針對不同基因採用不同的引物進行qpcr,對於每乙個樣本還得設定乙個內參對照。用每個基因復孔ct值的平均值減去內參的平均值求的δct,再比較各組基因的表達差異。

也可以絕對定量,將稀釋的標準品和待測樣品同時進行qpcr,通過ct值根據標準曲線求絕對錶達量。

急!!懸賞!基因序列高度保守意味什麼有何意義

6樓:生物資訊研究者

一般來說:基因序列高度保守說明相對於其他基因這個基因對於這個物種的生存有相當重要的意義,通常稱他們為管家基因。他們可能編碼一些非常重要的蛋白質。

一旦這個基因發生突變,那麼這個物種可能發生嚴重的疾病甚至致死。

還有些情況比較特殊比較mirna通常來說都是保守的,但是通過實驗發現,有些卻是可缺少的。

不過正常情況下前一種的理論比較好理解。

7樓:網友

在幾種不同型別生物體中非常相似的dna序列。科學家認為這些跨物種的相似性證明了某個特殊的基因完成了一些許多生命形式所必須的基本功能,因此在進化過程中保留了這些序列。這些序列一般是生命活動所必需的,其突變常常導致死亡,所以在進化中儲存下來的突變很少,因而表現為高度保守。

8樓:網友

就是鹼基對配對時,有一定的選擇,這種選擇就是高度的保守以味。

基因組做qpcr時,一般濃度為多少

9樓:網友

提取中會汙染任何物質 蛋白 糖類 rna等。

其純度一般用核算吸收od260/od280(蛋白質汙染)分析判斷,純dna比值為。

此外用od280/od230估計鹽離子是不是太高。 5.分光光度分析dna的a280/a260小於;不純,含有蛋白質等雜質。

如何獲知目的基因中高度保守的序列片段

10樓:網友

與其同家族的所有蛋白序列進行blast~找出保守序列~

如何做兩個指標合併後的roc曲線

roc曲線可以先做logistic模型,然後用概率去擬合曲線 我以前回答過很多次這個問題 網上應該也能夠找到 graphpad pri origin sigmaplot等等都可以繪製。下圖左邊是pri 繪製的 右圖是excel繪製的。怎樣把多組roc曲線做在一張圖裡 建立一個xy的 然後對於第一個指...

如何判斷兩個基因是連鎖遺傳還是自由組合

首先選用具有這兩對基因控制的相對性狀 前題是這兩對基因分別控制兩對相對性狀 的生物個體 純合體 進行雜交,得到f1。例如aabb aabb,f1為aabb。然後可以用兩種方法進行判斷 1 f1自交,如果後代出現了四種表現型,並且比例為9 3 3 1,那麼可以判斷這兩對等位基因分別位於兩對同源染色體上...

如何查詢兩個基因是否在訊號通路間存在聯絡

代謝通bai路 目du前在通路資料庫zhi pathway database 中代謝dao通路是建立得最好的,有大約 內90個參考 容代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或ec號組成的網路。利用如下方法可通過計算機構建出生物體特有 的代謝通路 先根據基因的序列相似性和位置相關性確定基因組中酶的...